Eva Navrátilová se dlouhodobě věnuje projektům zaměřeným na ochranu životního prostředí a osvětu veřejnosti. Podílí se na organizaci tradiční akce Čistá Vysočina, která každoročně zapojuje desítky tisíc dobrovolníků do úklidu přírody v celém kraji. Projekt se stal symbolem spolupráce obcí, škol, neziskových organizací, firem i jednotlivců. Kraj Vysočina v rámci akce zajišťuje materiální podporu i svoz odpadu. Čistá Vysočina je součástí programu Zdravý Kraj Vysočina a MA21 a přispívá k tomu, aby se Vysočina stala příkladem regionu, kde lidé pečují o své okolí.